DNA片段分选磁珠操作全指南:从预处理到洗脱的精准技巧
磁珠法已成为DNA/RNA片段分选的核心技术,通过磁珠表面羧基基团对核酸的可逆吸附,实现精准的片段筛选和杂质去除。其操作简便、兼容高通量自动化设备的特点,使其在NGS文库构建中广泛应用。
磁珠分选标准流程
1. 磁珠预处理:
从4℃冰箱取出磁珠,室温平衡30分钟,涡旋振荡1分钟确保均匀悬浮。
避免低温导致PEG沉淀,影响分选效率(PEG浓度需稳定在21%-24%)。
2. 磁珠与样本混合:
根据目标片段大小调整磁珠比例:
≥400bp片段:磁珠与样本体积比0.6:1;
100-300bp片段:按0.8:1至1.2:1梯度添加。
移液器轻柔吹打混匀后,室温静置5分钟,促进核酸吸附。
3. 磁性分离与洗涤:
将混合液置于磁力架静置3-5分钟,待溶液澄清后弃上清(含小片段或杂质)。
加入200μL新鲜配制的80%乙醇清洗两次,离心管始终置于磁力架上操作,避免磁珠流失。
4. 洗脱与质控:
开盖干燥磁珠3-5分钟至无乙醇残留(防止抑制下游PCR)。
加入20-50μL无核酸酶水洗脱,涡旋振荡10秒后静置2分钟,磁力分离后收集上清。
使用Qubit定量及Agilent 2100分析片段分布,确保目标片段占比>90%。
技术优势与场景适配
高灵敏度:可处理低至1μg的DNA样本,回收率>90%。
灵活分选:支持100-1000bp片段范围,适配Illumina、华大智造等平台。
自动化兼容:配合睿科、Hamilton工作站实现96孔板高通量处理,提升效率3倍。
注意事项:
避免磁珠长时间暴露于高温环境(>30℃),防止PEG降解。
分选含接头二聚体的文库时,建议二次分选(磁珠比例提高至1.5:1)。
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