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2026-04-08

大熊猫DNA提取——找回“小核桃”


这是一项藏在粪便中的破案技术,能从大熊猫的便便里抽取出完整的DNA密码本,确认野生大熊猫的身份及踪迹。今天,我们就来聊聊这项神奇的技术。

 

 

 

先看一个真实案例:DNA确定身份,找回放归三年的小核桃

 

在展开技术细节之前,我们先来看一个精彩的真实案例。201812月,中国大熊猫保护研究中心的大熊猫琴心小核桃在都江堰市龙溪-虹口国家级自然保护区被放归大自然,这是史上首次在成都和岷山山系放归人工圈养繁育的大熊猫。

 

三年后的202111月,都江堰市国有林场在野外监测工作中,通过红外相机拍摄到了野生大熊猫的宝贵影像。经专家仔细辨认,疑似是2018年放归的个体。为了确认这头大熊猫的身份,中国大熊猫保护研究中心派出专家团队前往现场勘验,在海拔1346米安放红外相机点位附近,发现了大熊猫食竹和卧穴的痕迹,并采集了粪便样品做进一步检测。

 

接下来就轮到DNA技术登场了——通过从粪便中提取DNA,采取非损伤性取样的DNA个体识别法,经过比对,科研人员最终确定这只5岁多的雌性大熊猫正是2018年放归的小核桃

 

专家们非常激动。从拍摄到的影像片段上看,这只大熊猫体态圆润、活力和精神状态正常,说明其在野外生存状况良好。当DNA结果证实确实是小核桃后,说明对’小核桃”的两年野化培训是成功的。

 

值得一提的是,截至20221月,中国大熊猫保护研究中心已野化培训并放归了11只圈养大熊猫,在野外存活9只,小核桃便是其中之一。 

 

为什么要从粪便中提取DNA

 

你可能会问:为什么不直接用血液提取DNA,而要费这么大劲研究粪便?答案是——非损伤性取样的必要性。

 

大熊猫是濒危物种,种群数量少、分布狭窄、遗传多样性贫乏,还面临着近亲繁殖和生殖能力差等问题。获取血液样本需要捕捉或麻醉大熊猫,这对本就脆弱的种群会造成额外的干扰和风险。因此,科研人员开发出了一套非损伤性基因取样技术——在不捕获、不触及动物的情况下,通过收集粪便、毛发、脱落羽毛、食物残渣等样品来获取DNA

 

粪便是最好的非损伤性样品之一。 大熊猫每天都要吃大量竹子,排便频繁,粪便样品相对容易在野外采集。通过从粪便表面的肠道脱落细胞中提取DNA,科研人员可以开展种群数量调查、遗传多样性评估、亲缘关系鉴定等一系列研究。

 

粪便DNA提取的三大难题

 

 

 

不过,从粪便中提取DNA并不是一件容易的事。粪便样品里存在三大难题:

 

第一,抑制物多。 粪便中含有大量PCR扩增的抑制物(比如胆红素、胆汁盐、腐殖酸等),这些物质会严重干扰后续的PCR反应,导致扩增失败或结果不准确。

 

第二,DNA易降解。 大熊猫粪便在野外环境中暴露,受到阳光、湿度和微生物的作用,DNA很容易降解成小片段,难以获得完整的基因组信息。

 

第三,背景DNA干扰。 粪便中除了大熊猫自身的DNA,还有大量肠道微生物和食物来源(竹子)的DNA,如何特异性地提取目标动物的DNA也是一大挑战。

 

新百基粪便DNA提取试剂盒(M2008),采用自主研发的缓冲液体系和磁珠,搭配标准化的操作流程,能有效解决上述问题,提取纯化的DNA产物能直接应用于后续PCR

 

试剂盒应用:从大熊猫粪便中提取DNA

 

样本大熊猫粪便

 

实验流程:向样本中加入裂解液后,按照试剂盒操作流程提取DNA

 

实验结果:

 

 

H12H13H14:食用竹笋熊猫粪便样本

H15H18H25:食用竹叶熊猫粪便样本

 

提取出来的DNA能做什么?

 

从粪便中提取出来的DNA,可以用于多种研究目的,以下是几个主要的应用方向:

 

个体识别与种群数量调查。 通过微卫星DNA标记分析,可以像人类指纹一样建立起大熊猫的“DNA身份证。在不同时间、不同地点采集的粪便样品,如果显示出相同的DNA指纹图谱,就证明来自同一只大熊猫,从而估算出种群中个体的大致数量。

 

亲子鉴定与遗传管理。 大熊猫有一种特殊的婚配方式——多雄配多雌。一只雌性大熊猫可以与多个雄性大熊猫进行交配,交配之后问题就来了:不知道谁是亲生父亲。经过十几年的努力,科研人员开发出了可靠的DNA分子标记技术,能够把大熊猫的真实父亲找出来。截至2021年,已经对超过130只大熊猫完成了亲子鉴定,这些鉴定结果已经进入大熊猫的国际谱系,用于实施科学的遗传管理。同时,可为大熊猫都建立家谱,指导繁育配种,避免近亲繁殖,保护大熊猫的遗传多样性。

 

性别鉴定。利用性别鉴定引物,能够在粪便DNA中稳定地扩增出性别特异性片段,准确鉴定出大熊猫的性别。

 

从一坨不起眼的粪便中,抽取出大熊猫的生命密码它让我们能够在不打扰大熊猫的情况下,了解它们的种群数量、性别比例、亲缘关系和遗传多样性;

 

这项技术体系的建立,不仅促进了大熊猫保护遗传学的研究,也为其他野生动物的保护遗传学研究提供了良好的技术借鉴。

 

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