【案列分享】鱼类DNA提取
鱼可以来拿干嘛?
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当然,还可以提DNA
今天我们就来分享一个案例——鱼类DNA提取
首先,我们先了解为什么要进行鱼类DNA提取,有什么意义?
——答案是肯定的。
①通过鱼类DNA可以确定鱼苗的父母,避免近亲繁殖,筛选优良性状(如生长快、抗病力强)
②非法捕捞与鱼翅贸易鉴定:在海关或市场上,对无法辨认的鱼类或加工后的鱼翅进行DNA检测,可快速鉴定出物种(尤其是鲨鱼、蝠鲼等濒危种),为执法提供证据。
③系统发育与分类学:对难以从形态上区分的近缘种(如多种小型的虾虎鱼),用鳍条DNA序列即可准确厘清其进化关系和物种界限。
④种群识别与洄游路线研究:不同地理种群的鱼类DNA有细微差异。通过分析捕捞个体或放流鱼苗的鳍条,可确定其所属种群,进而了解洄游规律,划定关键栖息地。
既然,研究鱼类DNA有这么多意义,那么如何获得鱼类DNA?
——其实很简单
样本准备:鱼鳍(酒精浸泡冷冻保存)
试剂准备:新百基动物组织DNA提取试剂盒(M2012)
样本预处理:取细细的一小条鱼鳍清洗后剪碎2-3mm,加入预处理液混匀,温浴
实验流程:整个实验流程按照试剂盒操作流程进行操作
实验结果:
DNA浓度大于80ng/ul,A206/280≈1.8,A260/230大于2.0,DNA浓度高,纯度优。
新百基动物组织DNA提取试剂能较好的应用于鱼类DNA提取中,产物可直接用于下游PCR、一代测序和NGS等。
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